Le whisky est distillé sur leur site d'Islay depuis 1742. La première distillerie légale a été fondée ici en 1816, et une seconde a été ajoutée en 1817. En 1837, ils fusionnèrent sous le nom de Lagavulin.
Il y a eu plusieurs fermetures au cours de la longue histoire de la distillerie, mais elle a toujours été rouverte et fait désormais partie du groupe de spiritueux Diageo.
À ce jour, les distillateurs n'utilisent que de l'eau cristalline des lacs Lochan Sholum et Loch Sholum pour leurs produits.
Le malt naturel de haute qualité de Port Ellen Maltings contribue également à l'excellente qualité du whisky Lagavulin.
La distillation s'effectue traditionnellement dans deux alambics de lavage à vapeur et deux alambics à spiritueux.