Le même site abritait également l'ancienne distillerie Clynelish, fondée en 1819 par George Granville Levison-Gower, plus tard duc de Sutherland. Cependant, l’ancienne distillerie n’a fonctionné que pendant une courte période, puis a fermé ses portes.
La distillerie actuelle appartient à United Distillers depuis 1987 et fait partie du groupe de spiritueux Diageo depuis 1998.
Le whisky Clynelish est très populaire en tant que single malt. L'eau nécessaire à cela provient de la rivière Clynemilton Burn.