L'histoire à succès de Captain Morgan a commencé en 1944 lorsque la société canadienne Seagram a fondé la Captain Morgan Rum Company et a commencé à produire du rhum.
Parmi les clients se trouvait Levy Brothers, une pharmacie de Kingston, la capitale jamaïcaine. Levy Brothers a ajouté des herbes et des épices au rhum Seagram et l'a laissé vieillir davantage.
Samuel Bronfman, PDG de Seagram à l'époque, a tellement aimé la boisson qu'il en a acheté les droits de distribution.
Dans les années 1950, Seagram vend la marque Captain Morgan à Diageo.